В зависимости от задач организации можно применить разные решения для управления проектами:
1) Трекеры задач
2) Системы типо СRM и ERP со встроенным модулем для управления проектами
3) Профессиональные узкоспециализированные системы, заточенные только под управление проектами.
Если вы профессиональная организация, и хотите на высоком уровне управлять проектами с учетом методологии и стандартов, вам точно стоит посмотреть в сторону специализированной системы